Адрес:
Телефон:
Прием ведется по записи

Единая справочная служба

8-800-550-24-13
 

Генотип собаки теперь полностью расшифрован.

Генотип собаки теперь полностью расшифрован



Генотип собаки теперь полностью расшифрован. Сообщество биологов-генетиков выполнило полную расшифровку генотипа немецкого боксера. Итогом работы стало создание карты полиморфизмов (однокуклеотидных - SNP) генетического кода собаки.
Общее количество нуклеотидов находящихся в 78 хромосомах (соматические клетки) составило 2,4 млрд., в сравнении у человека в 46 хромосомах число нуклеотидов составляет 3,1 млрд.

Следует упомянуть, что первая расшифровка генома данного вида была выполнена с низким показателем информативности и было расшифровано всего 80% от общего размера. Первым объектом для такого анализа стал пудель по кличке Шэдоу, а само исследование было инициировано и проходило под руководством К. Вентера.
Новое исследование команды генетиков возглавила К. Линдбланд-Тох (содиректор по программе секвенирования генома при МТИ (Массачусетский технологический институт) при Институте Броад (Broad Institute). Точность данных изысканий на этот раз была значительно выше.Генотип собаки теперь полностью расшифрован.


Образец ДНК был взять у немецкого боксера по кличке Таша. Это породистая собака с родословной. Для создания более чистой породы ее предки неоднократно подвергались инбридингу – то есть скрещиванию в пределах небольшой популяции, иногда близкородственному. Благодаря этому у нее был сформирован практически идентичный комплект набора хромосом, что значительно упростило выполнение поставленных задач расшифровки, связанных с достижением максимальной достоверности и точности эксперимента.


Процесс расшифровки нуклеотидной последовательности подразумевает наработку ДНК в нужном количестве (амплификация) посредством их многократного копирования. В лаборатории проводится ПЦР (полимеразная цепная реакция) которая позволяет увеличивать объем исследуемого материала. В последующем происходит определение последовательности посредством секвенирования генома - ДНК-молекула «нарезается» на более мелкие фрагменты, затем происходит их сравнение с уже имеющейся библиотекой последовательностей. На заключительном этапе фрагменты сшиваются, и происходит их полный компьютерный анализ и сопоставление. Чем чаще проводилось считывание – тем выше точность выполняемой процедуры. Коэффициент избыточности при первой расшифровке составил 1,5. При недавнем исследовании был достигнут более точный результат - проанализировано до 99% от всего генома и избыточность составила 7,5, что позволяет говорить о большей полноте и достоверности.


Генотип собаки теперь полностью расшифрован.Кроме выполнения полной расшифровки генетической последовательности данной породы были выполнены исследования и частично прочтены геномы еще некоторых пород, а также ряда других млекопитающих семейства псовых – волка и койота. Результаты обнаружили практически стопроцентное совпадение геномов. Было установлено, что лишь около 0,15% от общей последовательности кодирует те отличительные особенности, которыми обладает порода либо родственные виды. Проведенное сравнение геномов родственных видов и пород позволило составить точную карту однонуклеотидных полиморфизмов (таких мест в коде, где различные геномы отличаются всего лишь одним нуклеотидом).


В качестве объекта для исследований собака стала удобной моделью. Во-первых, генетическое сходство их генома с геномом человека намного выше чем, например, между мышью и человеком. Во-вторых, многие вопросы медицины, эволюционной биологии или эмбриологии можно ставить в задачи для проверки при изысканиях, благодаря большому многообразию пород данного подвида. Это позволяет значительно продвинуть изучение генетически ассоциированных заболеваний, таких как рак или диабет, эпилепсия и т.п., к тому же многие болезни у собак и людей сопоставимы.
Очередной интересной находкой стало выяснение того факта, что количество не кодирующих участков ДНК («мусорная ДНК», которая не участвует в кодировании молекул белка) совпадает у человека и собаки. Это говорит об их высокой эволюционной устойчивости. Ведь они проявили себя как довольно стабильные последовательности в условиях естественного отбора. Все это свидетельствует о важности этих фрагментов и о неприменимости понятия «мусорные» либо не информативные, а роль, которую они отыгрывает, еще предстоит выяснить.

Как к Вам обратиться?*

Ваш телефон:*

Комментарии:

Введите числа с картинки:

* - поля обязательные для заполнения

Запись на прием

Как к Вам обратиться?*

Укажите Ваш E-mail:*

Телефон:

Введите числа с картинки:

* - поля обязательные для заполнения